科研做理论时，可以使用以下几款软件：

印象笔记

功能：支持文字、语音、图片等多种信息的记录，多平台同步，具备网页剪报功能。可以插入PDF、DOC、PPT等文件格式，并支持标签管理和文献引用。

Citespace

功能：用于科学文献分析和可视化，支持多种文献分析方法和可视化技术。可以显示学科或知识域的发展趋势，形成研究前沿领域的演进历程，并以图形方式呈现复杂的数据结构，便于用户理解。

Zotero

功能：免费开源的文献管理工具，支持多设备同步、团队协作以及多种引用格式。可以自动抓取网页和数据库中的文献信息，方便插入引用并自动生成参考文献。

Origin

功能：强大的数据分析和图表绘制软件，支持统计分析、曲线拟合、信号处理等多种数据分析功能，具有丰富的图表类型。用户可以通过直观的界面进行数据操作，并通过编程脚本自定义分析流程。

EndNote

功能：由Thomson Research Soft开发的学术信息管理软件，主要用于检索科技文献和管理文献引用。能够帮助用户高效整理文献、插入引用、生成参考文献列表。

NVivo

功能：支持定性和混合方式搜索的软件，适用于整理、分析和找到非结构化或定性数据。可以帮助用户发现数据中的联系，找到新的见解。

Mendeley

功能：免费的跨平台文献管理软件，同时也是一个在线的学术社交网络平台。可以一键抓取网页上的文献信息添加到个人library中。

Deepl

功能：基于深度学习技术的智能翻译软件，支持多达90种语言的互译，适合科研人员使用。

这些软件涵盖了文献管理、数据分析、图表绘制、翻译等多个方面，可以满足科研人员在理论研究和论文写作中的各种需求。建议根据具体需求选择合适的软件，以提高科研效率。