FunRich

功能：主要用于基因和蛋白质的功能丰富和相互作用网络分析。

特点：支持多种图表形式（Venn, Bar, Column, Pie和Donut）来图形化描述分析结果，并允许用户加载自定义数据库。

OmicShare tools

功能：提供158个小工具，其中14个与基因功能富集分析相关，包括GO、KEGG、DO、Reactome、GSEA富集分析等，以及个性化绘图工具。

modEnrichr

功能：基于gene list的基因富集分析工具，支持常见模式生物（human、mouse、fish、fly、worm和yeast）。

KOBAS

功能：支持5944个物种，主要包括基因注释（Annotation）与富集分析（Enrichment）。

David

功能：医学文章常见的工具，主要用于基因功能注释和富集分析，但版本更新较慢。

Coexpedia

功能：查询基因共表达网络的工具，包含大约800万个共表达基因，基于384个人类GEO数据集和248个小鼠GEO数据集构建。

Geneious

功能：综合性生物信息学软件，支持序列比对、系统学分析、引物设计、克隆和限制性分析、蛋白质结构查看、自动化医学搜索等功能。

这些软件涵盖了从基因功能富集分析到基因共表达网络构建的多种需求，用户可以根据具体需求选择合适的工具进行基因交集分析。