卖软件开票的流程如下：

登录税务系统

商家首先需要登录到当地的税务系统。

选择“开具发票”功能

在税务系统中，选择“开具发票”或类似的功能选项。

输入客户信息

输入客户的详细信息，包括名称、税号、地址、电话等。

选择软件销售项目

选择与所售软件相关的信息，如软件产品名称、版本号、数量、单价和金额等。

核对发票信息

仔细核对所有填写的发票信息，确保准确无误。

打印并交给客户

确认信息无误后，打印发票并交给客户。如果客户需要，也可以提供电子发票。

选择合适的发票类型

根据软件销售的特点和客户需求，选择合适的发票类型。一般纳税人可以选择增值税普通发票或增值税专用发票，而需要抵扣增值税的企业客户则需要开具增值税专用发票。有些客户可能还需要电子发票或纸质发票。

规范填写发票内容

严格按照规定的内容和要求填写发票，确保所有信息的准确性和完整性。例如，在软件产品名称一栏中填写软件的名称和版本号，在数量一栏中填写实际销售的软件数量等。

遵守相关税务法规

在开具发票的过程中，必须遵守相关的税务法规，包括发票的开具时限、保存和归档等规定，以确保发票的合法性和有效性。

注意税收政策

了解并遵守适用于软件销售的税收政策，以便正确开具发票并享受相关税收优惠。

通过以上步骤，可以确保软件销售发票的开具既符合法规要求，又能满足客户需求。建议在开具发票前，先咨询当地的税务部门或专业的财务人员，以确保整个流程的准确性和合法性。