自有软件缴税涉及多个环节和税种，具体流程和计算方法如下：

确认收入

根据合同条款和实际情况判断收入的确认时间以及金额。

计算应纳税所得额

应纳税所得额 = 收入 - 相关成本、费用等支出项目。

选择税种及税率

增值税：

一般纳税人：销售自行开发生产的软件产品，按17%的税率征收增值税，实际税负超过3%的部分实行即征即退政策。

小规模纳税人：生产销售计算机软件按6%的征收率计算缴纳增值税。

个人所得税：

个人提供或转让商标权、著作权、专有技术或技术秘密、技术诀窍取得的所得，需缴纳个人所得税，税率大约为6.8%。

申报纳税

定期向税务部门申报纳税，提交相关财务报表。

缴税

根据税务部门通知，完成税款缴纳。

税务管理

建立税务档案，进行税收优惠申请等。

建议

保持关注税收政策更新：软件企业需时刻关注税收政策的变动，确保合规纳税。

妥善保存凭证和资料：在税务处理过程中，务必保留好所有相关的凭证和资料，以备税务部门查验。

利用工具辅助计算：如使用Excel等工具辅助计算个人所得税，提高计算准确性和效率。

通过以上步骤，自有软件企业可以顺利完成税务申报和缴纳工作。