要开发一款教育系统设计软件，需要遵循以下步骤：

需求分析与规划

明确软件的定位和目标用户群体，例如是针对中小学生的学科辅导类教育小程序，还是提供综合教育服务的在线教育平台。

分析市场上现有的教育软件，找出竞争对手的优势与不足，以便在开发过程中突出自身特色。

选题与教学设计

确定软件要实现的教育目标和效果，选择合适的主题。主题应来源于培养目标或课程教材中的重点与难点。

进行教学设计，包括分析学习者特征、确定教学内容与教学目标、选择与设计媒体信息、建立教学内容知识结构、设计评价与总结。

系统设计

进行超媒体结构设计、交互界面设计、导航策略设计等。

搭建开发环境，选择合适的编程语言和开发工具，例如Python及其相关库（Tkinter、pandas、matplotlib等）。

软件开发

根据设计文档进行软件制作，包括编写代码、搭建用户界面、处理用户交互、连接数据库等。

在开发过程中，注重软件的科学性、实用性、创新性和多样性，同时关注数据安全和隐私保护。

测试与修正

进行实际测试和用户反馈，确保软件的实用性和易用性。

根据测试结果和用户反馈进行修正和优化。

部署与维护

将软件部署到目标平台，如Windows、Mac、安卓或iOS系统。

持续监控软件的运行状态，及时进行升级和维护，确保软件的稳定性和可持续性。

推广与反馈

通过各种渠道推广软件，吸引用户使用。

收集用户反馈，持续改进软件功能和性能，以满足未来的需求和挑战。

通过以上步骤，可以开发出一款符合用户需求、具有科学性和实用性的教育系统设计软件。