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高斯软件上如何标二面角

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在高斯软件中标定二面角,可以采用以下步骤:

确定二面角的定义

二面角是指由两个平面所夹的角,这两个平面分别包含两个原子及其共价键。二面角的取值范围是[-180º, 180º],正负号由“右旋法则”确定。

选择输入方法

高斯软件支持直角坐标和内坐标两种输入方法。在内坐标方法中,只需在采用直角坐标方法输入的原子的元素符号后加一个整数0即可。

输入二面角的坐标

直角坐标法:如果选择直角坐标法,需要输入三个原子的笛卡尔坐标,然后通过计算确定二面角。

内坐标法:如果选择内坐标法,需要输入每个原子的相对位置,包括与其他原子的键长、键角以及二面角。具体格式可以参考高斯软件的输入规范,例如在分子内坐标输入中,第一行表示计算方法与基组,第二行表示名称,第三行表示分子电荷与自旋多重度,第四行开始为分子内坐标。

保存文件

完成二面角的输入后,保存文件。如果使用内坐标表示,可以直接保存为`.gjf`格式。如果使用直角坐标表示,需要先保存为笛卡尔坐标格式,再保存为`.gjf`格式。

验证二面角

可以使用高斯软件中的绘图工具或通过计算验证二面角是否正确。

示例

假设我们要标定一个由原子A、B、C组成的二面角,其中A和B、B和C分别形成两个平面,可以使用以下步骤:

直角坐标法

输入A(x1, y1, z1)、B(x2, y2, z2)、C(x3, y3, z3)。

通过向量叉乘计算两个平面的法向量,然后计算这两个法向量的夹角,得到二面角。

内坐标法

输入A的坐标后加0,B的坐标后加0,C的坐标后加0。

输入A与B之间的键长、键角,以及A与C之间的键长、键角。

根据这些信息,高斯软件会自动计算并显示二面角。

通过以上步骤,可以在高斯软件中准确地标定二面角。