在软件开发中，确定软件著作权的归属通常遵循以下原则和方法：

独立开发

如果软件是由一个开发者独立完成的，那么著作权自然归属于该开发者。开发者可以通过保留完整的开发文档和代码修改记录来证明自己是软件的原始著作权人。

合作开发

对于合作开发的软件，著作权的归属通常由合作开发者通过签订书面合同来约定。如果合同中没有明确约定，那么各合作开发者对各自开发的部分可以单独享有著作权；如果软件不能分割使用，著作权则由各合作开发者共同享有。

委托开发

在委托开发的情况下，著作权的归属由委托人与受托人通过签订书面合同来约定。如果没有书面合同或者合同未作明确约定，著作权通常归属于受托人。

职务开发

如果软件是公民在法人或其他组织中任职期间开发的，并且符合以下任一条件：针对本职工作中明确指定的开发目标所开发的软件；开发的软件是从事本职工作活动所预见或自然的结果；主要使用了法人或其他组织的资金、专用设备、未公开的专门信息等物质技术条件所开发并由法人或其他组织承担责任的软件，那么著作权归属于该法人或其他组织。

国家机关下达任务开发

对于由国家机关下达任务开发的软件，著作权的归属与行使由项目任务书或合同规定。如果项目任务书或合同中没有明确规定，著作权归属于接受任务的法人或其他组织。

第三方认证

在某些情况下，第三方认证也可以作为证明软件著作权归属的依据。例如，一些知名的开源软件项目可以通过开源许可证的方式证明自己是软件的原始著作权人。

源代码署名

开发者还可以在源代码中署名，以证明自己是软件的原始著作权人。署名信息应当真实有效，并在软件开发过程中及时更新。

软件登记

在国家版权局进行软件登记也是确定软件著作权归属的重要途径之一。通过登记，可以获得国家法律保护，证明自己是软件的原始著作权人。

综上所述，确定软件著作权的归属需要根据开发方式、合同约定、法律规定等多种因素来综合考虑。建议开发者在开发过程中及时保留相关文档和记录，并在必要时签订合同或进行软件登记，以确保自己的合法权益得到保障。