处理学校盗版软件的问题，可以采取以下步骤：

确认侵权情况

首先，需要确认学校确实使用了盗版软件。这可以通过检查软件授权信息、购买记录或联系软件供应商来完成。

收集证据

收集与盗版软件相关的所有证据，包括软件安装位置、使用情况、相关人员的联系方式等。这些证据在后续的处理过程中非常重要。

联系版权所有者

及时与软件版权所有者联系，告知他们学校使用盗版软件的情况，并表达歉意和愿意赔偿损失的意愿。

学校内部处理

向学校管理层报告盗版软件的使用情况，建议学校采取措施停止侵权行为，如删除盗版软件、禁止使用未经授权的软件等。

法律途径

如果学校不采取任何行动，可以考虑通过法律途径解决问题。可以向法院提起诉讼，要求停止侵权行为并赔偿损失。

行政投诉

向当地工商行政管理部门或版权管理部门投诉，请求他们介入处理侵权行为。

合作打假

与第三方打假公司合作，由他们垫付维权成本，并分享维权收益。

加强版权保护

对教学资源进行加密，与律师团队合作制定严格的版权声明和用户协议，以防止类似事件再次发生。

宣传教育

加强与用户的沟通，提醒他们尊重知识产权和版权，提高全校师生的版权意识。

监控审核

定期检查学校内部使用的软件，发现侵权行为立即采取行动。

通过以上步骤，可以有效地处理学校盗版软件的问题，保护版权所有者的合法权益，同时也有助于维护学校的良好声誉和教学质量。