办理软件著作权证的费用如下：

计算机软件著作权登记费

基本费用：250元/件次。

多种文档登记：每增加一种文档，增收80元。

软件著作权合同登记费

每次100元。

软件著作权合同登记证书费

50元/件。

变更或补充登记费

150元/件次。

请求延期处理费

第一次100元/件次，第二次200元/件次。

软件源程序封存保管费

100页为120元，超过100页的，每增加1页增收2元。

软件权利转移备案费

转让或许可：300元/件次。

继承：200元/件次。

软件著作权续展费

550元/件次。

其他费用

查询费：计算机信息库查询费（题录库、文摘库）和追溯查询均有不同费用标准。

建议在申请软件著作权时，详细了解并确认所需费用，以便做好预算和准备。如果需要代理服务，也可以咨询相关代理机构了解代理费用。