Cytus每次游戏的满分是1,000,000分。这个分数由两部分组成：判定分（Judgment Score）和连击分（Combo Score）。判定分占900,000分，平均分配给每个Note；连击分占100,000分，通过连续完美击中音符来累加。在结算时，各部分得分会四舍五入至整数后相加得到最终总分。

为了获得满分，玩家需要在游戏中尽可能多地完美击中每个音符，并且保持连击的连续性。任何失误，如MISS或错误击打，都会导致连击分数的显著损失。