北京软件著作权包括以下权利：

发表权：

即决定软件是否公之于众的权利。

署名权：

即表明开发者身份，在软件上署名的权利。

修改权：

即对软件进行增补、删节，或者改变指令、语句顺序的权利。

复制权：

即将软件制作一份或者多份的权利。

发行权：

即以出售或者赠与方式向公众提供软件的原件或者复制件的权利。

出租权：

即有偿许可他人临时使用软件的权利，但是软件不是出租的主要标的的除外。

信息网络传播权：

即以有线或者无线方式向公众提供软件，使公众可以在其个人选定的时间和地点获得软件的权利。

翻译权：

即将原软件从一种自然语言文字转换成另一种自然语言文字的权利。

应当由软件著作权人享有的其他权利。

在北京，申请软件著作权的流程可以通过北京市版权保护中心官网进行在线申请，官网提供了详细的申请指南和表格，并提供了在线咨询服务。申请过程中需要提供软件的设计文档、代码、测试报告等材料，以证明你是该软件的合法开发者。