软件工程专业的算法课程主要包括以下几门：

算法与数据结构

离散数学

算法设计与分析

数据结构与算法

程序设计语言（如C/C++、Java）

这些课程构成了软件工程专业算法学习的基础框架，旨在培养学生掌握算法设计、分析和实现的基本技能，以及如何在软件工程实践中应用这些技能。