上海的软件知识产权主要包括以下几方面：

软件著作权

软件著作权是指软件的开创者或其他权利人依据有关著作权法律的规定，对软件作品所享有的各项专有权利。它属于一种民事权利，具备民事权利的共同特征。

在上海，软件著作权的申请和登记主要由中国版权保护大厅和上海市版权局负责。中国版权保护大厅是国家版权局认定的软件著作权登记机构，而上海市版权局则承担着软件著作权登记等重要工作。

专利权

专利权是指国家依法授予发明创造者的一种独占权。在上海，专利权保护的对象包括发明、实用新型和外观设计。

商标权

商标权是指商标所有者对其商标享有的专用权。商标权包括商标、地理标识等。

其他知识产权

除了上述主要类型的知识产权外，还包括商业秘密、集成电路布图设计、植物新品种等。

专业服务机构

上海市版权保护中心、上海市知识产权局、上海市律师协会知识产权专业委员会、上海市科技创新中心等机构，为软件开发者提供软件著作权的申请、登记和保护服务，以及版权保护法律咨询和诉讼服务。

标准化软件著作权

上海市标准化研究所开发的标准化软件著作权，旨在提高上海软件产业的竞争力和创新能力。该软件著作权属于上海市标准化研究所，是该研究所在软件开发领域的重要财产。

知识产权代理机构

申请人可以委托正规专业的知识产权代理机构办理软件著作权的申请和登记工作。例如，小盾知识产权代理公司可以提供相关服务。

综上所述，上海的软件知识产权涵盖了软件著作权、专利权、商标权及其他相关权利，并且有多个专业机构和代理机构提供相关服务和支持。