公司代理记账可以选择以下几款软件：

用友U8：

国内领先的企业管理软件，具备强大的财务核算、成本控制、供应链管理、人力资源等功能。

金蝶K3：

以其高效、稳定、可靠的特点广受用户喜爱，拥有完整的财务管理、采购管理、销售管理、物资管理等功能。

SAP：

全球领先的企业管理软件，拥有完整的财务管理、采购管理、销售管理、物资管理等功能。

中税在线：

国内领先的税务服务提供商，其“税务助手”软件在税务申报和缴纳方面具有优秀的性能表现。

百望股份：

国内市场占有率最高的税务软件企业，其“麒麟”系列产品被广泛应用于各行业代理记账公司。

用友税务：

以其强大的税务管理系统和服务优势获得了广泛的用户信赖。

金财管家：

专业的财务软件，票据管理功能出色。

云票据：

云端票据管理软件，具有移动化、智能化、安全可靠等特点。

票易通：

专业的票据管理软件，拥有完整的票据收集、分析、归档等功能。

金蝶kis：

专业版为小型工贸企业提供六大关键环节的财务管理，全面实现财务、业务、税务一体化管理。

用友财务软件：

包括总账、应收款管理、应付款管理、UFO报表、网上银行、票据通、现金流量、网上报销、报账中心、公司对账、财务分析、现金流量表、所得税申报等功能的财务会计基础软件。

管家婆：

中小企业管理软件，提供进销存、财务、生产、ERP、电子商务等企业信息化解决方案。

根通财务软件：

适合中小企业的财务管理软件。

金蝶简易记账：

具有记账、审计、结账、对账单等功能，并提供发票验证、快速查询等服务。

代理助理：

在线金融软件，主要功能是凭证管理、最终处理、基础设施和增值服务。

金碟记账软件：

为代理记账公司设计的软件，支持多种账套管理和灵活切换。

U会计：

适用于小型代理记账公司的软件，支持多种财务报表的自动生成和在线协作功能。

用友金蝶：

用友旗下的代理记账软件，提供完整的财务管理解决方案。

自会计：

近几年发展起来的代账软件，具备一键批量报税、一键批量取票、全流程智能自动核算等智能配置。

云代账：

轻量级的软件，注重软件易用性和涉及业务的全面性，管理客户和业务是其重要功能。

金蝶易记账：

具备记账、查账、结账、报表等多种功能，并提供发票验证、快递查询等服务。

代账助手：

在线财务软件，主要功能有凭证管理、期末处理、基础设置、增值服务等。

用友易代账：

功能强大，特别适合中大型代理记账公司使用，提供了全面的功能模块。

金蝶账无忧：

专为中大型代理记账公司设计的财务软件，提供丰富的功能和便捷的操作界面。

亿企代账：

专为中大型代理记账公司设计的财务软件，涵盖多元化的功能。

金蝶云代理记账：

由中国知名软件公司金蝶开发的在线会计软件，具有自动化核算、电子凭证、财务分析等功能。

用友T3：

集成化的财务管理系统，适合中型和大型企业使用。

中科天玑：

国内最早的会计软件之一，具有全面的会计处理功能。

三盛财务：

在线财务管理软件，支持多种会计处理方式。

这些软件各有特点，代理记账公司可以根据自身需求和规模选择合适的软件。