舰船指挥软件主要包括以下几种：

Aegis系统：

用于舰船的航行控制、武器系统控制和通信系统，帮助舰船指挥员进行航行控制、目标追踪和武器系统操作。

航海导航软件：

用于导航和航线规划，帮助舰船在海上进行精确的航行操作。

C4ISR系统：

包括指挥、控制、通信、计算机、情报、监视和侦察系统，用于战术决策和作战指挥。

战术决策软件：

辅助指挥官进行战术规划和决策，提高作战效率。

MATLAB：

虽然主要用于空军的复杂数据分析、模拟和仿真，但其强大的编程和计算能力也被广泛应用于其他军种的科研和工程项目中。

LabVIEW：

图形化编程环境，适用于海军的大量数据采集、控制和监控任务。

C++：

高效的编程语言，适用于开发底层驱动、嵌入式软件和实时系统，也常用于陆军的开发工作。

舰队指挥官Battleship-Fleet Command：

海战棋游戏，玩家需要在限定的格子内安排自己的战舰与敌方进行战斗，结合了策略和运气元素。

战舰沙盘：

游戏辅助工具，提供实时数据、战舰数据显示和插件专家等功能，帮助玩家更好地了解单场数据和战力变化。

驱逐舰指挥官：

二战题材的海战模拟游戏，玩家通过手动操控战斗来挑战经典战役。

巅峰战舰：

采用先进的模拟技术，为玩家提供真人实时交战的平台，支持多种战舰和战斗模式。

舰队指挥官（手游）：

即时战略海战手游，玩家需要实时指挥舰群行动，并进行战术规划和决策。

这些软件涵盖了从航行控制、武器系统操作到战术决策和战斗指挥的各个方面，满足了不同军种和作战需求。建议根据具体需求选择合适的软件，以提高舰船指挥的效率和作战能力。