苹果商店中很多游戏消失的原因主要有以下几点：

未获得版号：

根据中国监管部门的要求，所有付费或提供内购的游戏都需要获得许可证后才可以上架。苹果在2020年7月冻结了没有许可证的游戏进行更新，并在8月份下架了近3万款游戏。到2020年12月31日，被下架的游戏数量达到了将近4万款。

版号提交不及时：

苹果要求开发者在2020年7月1日后提交游戏版号，未提交版号的游戏如未能及时提交，开发者将无法更新游戏内容，且存在下架风险。

政策变化：

国家突然加强了对游戏行业的监管，要求所有有付费功能的游戏必须获得版号，这一举措让许多之前未提交版号的游戏面临下架风险。

平台审核：

苹果商店对游戏的上架有严格的审核要求，只有通过审查的游戏才能够在苹果商店里面进行上架，否则无法搜到。

综上所述，苹果商店中很多游戏消失的主要原因是这些游戏未获得必要的版号或未能及时提交版号信息，导致被苹果商店下架或无法搜索到。这一变化对游戏开发者和玩家都产生了较大影响，尤其是对那些依赖苹果平台盈利的游戏开发团队。