软件问题取证可以通过以下方法进行：

软件指纹分析：

通过提取软件的特定特征码或指纹，并与正版软件的特征码进行比对，以识别是否存在未经授权的副本。这种方法可以在没有联网的情况下进行。

系统日志审查：

检查系统日志文件，分析软件的安装、运行和使用记录，以确定软件是否被非法安装或使用，以及使用的时间和频率。

注册表检查：

在Windows操作系统中，通过检查注册表项，可以发现未经授权的软件安装和配置信息。

内存镜像分析：

在某些情况下，可以通过分析计算机的内存镜像来检测正在运行的软件，这可以实时捕捉到软件的运行状态，但可能需要较高的技术手段。

网络流量分析：

监控网络流量，分析数据包中的软件通信特征，以确定是否存在未经授权的软件在进行网络通信。这需要对网络协议有深入地了解和分析能力。

软件使用行为分析：

通过监测软件的使用模式和行为，比如启动时间、使用时长等，与正常使用模式进行对比，以识别异常行为。

第三方审计工具：

使用第三方软件审计工具，这些工具通常具备自动化的检测和报告功能，能够快速识别出未经授权的软件使用情况。同时，取证过程中收集的数据应妥善保管，以备法律诉讼时使用。

自行取证和委托律师调查取证：

由于知识产权案件专业性较强，由权利人自行取证可能有一定难度，而律师具有丰富的法律知识和办案经验，能提供专业的取证服务。

申请公证机关进行证据保全：

公证机关的法定业务之一是“保全证据”，公证证据具有推定为真的效果，可以为后续的维权提供有力的证据支持。

申请法院进行诉前证据保全：

在诉前，当事人可以向人民法院申请证据保全，以确保证据的真实性和完整性。

申请人民法院调取证据：

在诉讼过程中，权利人可以向法院申请调取相关证据，以支持自己的维权请求。

收集侵权证据：

包括侵权软件的副本、使用侵权软件的设备及相关记录等，以证明侵权行为的存在。

调查侵权行为过程：

通过网络追踪技术确定侵权软件的来源、传播路径及使用范围等，可借助专业的网络监测工具。

获取侵权方信息：

如侵权方的身份、联系方式、经营地址等，这有助于后续的维权行动。

保留自身软件权利证明：

如软件著作权登记证书、开发文档等，以明确自身的合法权益。

证据保全：

通过专业的技术手段，对软件侵权的证据进行固定和保存，确保证据的真实性和完整性，并提供具有法律效力的取证报告。

在取证过程中，应注意遵循法律程序，确保证据的合法性和有效性。同时，收集到的证据应妥善保管，以便在法律诉讼中使用。