软件企业自查问题可以遵循以下步骤：

确定自查内容和标准

明确自查内容，包括人力资源管理、财务管理、商业往来、产品质量等。

制定自查标准，参照相关法律法规、行业标准和企业内部规定。

制定自查计划和流程

规划自查的时间、地点、频率和人员安排。

设计自查流程，确保其具有实效性和可操作性。

确定自查人员和责任

选择具备相应知识和技能的自查人员。

明确各自查节点的责任和分工。

执行自查

按照自查计划进行逐项检查。

记录自查结果，发现潜在问题。

撰写自查报告

总结自查结果和问题。

提出整改措施和改进建议。

制定防范措施

确保整改措施得到有效实施。

降低企业法律风险和经营风险。

监督和评估

设立整改措施的定期评估机制。

设立内部监督机构，确保整改措施的持续有效执行。

持续改进

将整改成果纳入绩效考核体系。

根据评估结果及时调整整改计划。

通过以上步骤，软件企业可以系统性地进行自查，及时发现和解决问题，从而提高产品质量和管理水平。