游戏日版和美版存在差异的原因主要有以下几点：

本地化：

游戏需要符合当地的法律法规和风俗习惯，这就是所谓的“本地化”。例如，某些游戏中的角色或剧情可能会因为不同国家的文化差异而进行修改。

硬件和性能限制：

早期的游戏机，如FC，其硬件性能有限。日版游戏通常包含更多的过场动画和场景细节，但这些在美版中由于容量和性能限制而被删掉。此外，任天堂在海外发售的游戏机时，政策限制使用第三方MMC增强芯片，这也导致日版游戏在移植海外版时不得不进行修改。

审查机制：

不同国家和地区对游戏的审查标准和机构不同。例如，欧美不允许希特勒和纳粹出现在游戏中，而日本允许，因此日版游戏中与希特勒有关的内容需要换成其他代指。

市场需求和玩家偏好：

美国玩家可能更喜欢挑战更高难度的游戏，这可能是美版游戏难度普遍高于日版的原因之一。此外，美国市场当时有较为发达的租赁业务，如果游戏简单，玩家很快通关后就会更早归还，这也影响了游戏的难度设置。

厂商策略：

有些游戏在不同版本中表现不同，甚至有的游戏中的怪物和剧情都发生了一定的变化。这可能是因为厂商有意为之，以适应不同市场的需求。

显示制式差异：

日本和美国主要使用不同的视频接收制式（NTSC和PAL），这导致游戏在不同版本中画面表现有所不同。例如，PAL制式的游戏在日版中音调高，速度较慢，而NTSC制式的游戏在日版和美版中音调正常，速度正常。

综上所述，游戏日版和美版的差异主要是由于本地化、硬件和性能限制、审查机制、市场需求和玩家偏好、厂商策略以及显示制式差异等多种因素共同作用的结果。