阴阳师手游中的三大神器分别是：

八咫镜：

一柄镜子，现在供奉于三重县伊势市的伊势神宫。

天丛云剑：

又名"草剃剑"，源于创世神话中素盏呜尊的宝剑，他斩杀"八岐大蛇"后从其尾部取得。现在供奉于名古屋市热田区的热田神宫。

八尺琼勾玉：

又称"八阪琼曲玉"，一颗尖辣椒形状的玉坠。现在供奉于东京的皇居。

这些神器不仅具有强大的力量，还在日本的创世神话中扮演了重要角色。