代理记账公司使用的软件主要包括以下几类：

财务软件

用友U8：国内领先的企业管理软件，具备强大的财务核算、成本控制、供应链管理、人力资源等功能。

金蝶K3：以其高效、稳定、可靠的特点广受用户喜爱，支持财务管理、采购管理、销售管理、物资管理等功能。

SAP：全球领先的企业管理软件，拥有完整的财务管理、采购管理、销售管理、物资管理等功能。

金蝶易记账：具备记账、查账、结账、报表等多种功能，并提供发票验证、快递查询等服务，支持2011新小企业会计准则。

代账助手：在线财务软件，主要功能有凭证管理、期末处理、基础设置、增值服务等。

税务软件

中税在线：国内领先的税务服务提供商，其“税务助手”软件在税务申报和缴纳方面具有优秀的性能表现。

百望股份：国内市场占有率最高的税务软件企业，其“麒麟”系列产品被广泛应用于各行业代理记账公司。

用友税务：以其强大的税务管理系统和服务优势获得了广泛的用户信赖。

云账房：提供记账功能，并整合了税务申报、财务管理等多项功能，为企业提供一站式的财税管理解决方案。

诺诺云：集成财务记账、发票管理、报税申报等功能，支持全流程自动化处理。

票据管理软件

金财管家：专业的财务软件，票据管理功能出色。

云票据：云端票据管理软件，具有移动化、智能化、安全可靠等特点。

票易通：专业的票据管理软件，拥有完整的票据收集、分析、归档等功能。

其他辅助软件

浪潮云代账：简单易用，适合个体工商户和小型企业使用，提供总账管理、报表管理、一键报税、批量报税等功能。

易代账：用友旗下畅捷通公司研发的一款代账软件，功能全面、操作简便。

浪潮云会计：企业级财务管理软件，支持多终端登录和实时数据同步。

账信云会计：适合小微代理记账公司，界面友好，功能实用，支持多账套管理和灵活切换。

中科天玑：国内最早的会计软件之一，支持多种数据接口，可以与其他系统进行数据对接。

三盛财务：支持多种会计处理方式，如现金制、权责发生制等。

建议

选择适合自己公司规模和需求的财务软件是非常重要的。对于小型代理记账公司，可以选择操作简便、功能全面的软件，如金蝶易记账、代账助手等。对于中大型代理记账公司，则需要选择功能更为强大、稳定性高的软件，如用友U8、金蝶K3等，以满足复杂的财务管理需求。同时，考虑到税务申报和票据管理的需求，选择相应的税务软件和票据管理软件也是必不可少的。