龙之谷手游中的副本包括以下几种：

主线与深渊副本

玩家可以通过接受NPC的任务，在广场进入副本页面，选择关卡、领取奖励、进入深渊商店、增加可挑战次数以及上下章的切换。

巢穴副本

巢穴副本分为4章，分别是地狱犬、狮蝎、天启、大主教，每章有4个难度：容易、普通、困难、地狱。前3个难度可以获得不同材料用于制作装备，地狱难度则是展现技术的平台。

黑暗神殿

这是一个展现个人技术的平台，玩家每天可以进行无限次挑战，只能往更高层挑战，挑战进度会被保存，退出后可以继续挑战并获得奖励。

龙之远征

勇士的征程，玩家需要单挑各个变态的BOSS，每次远征战斗对BOSS造成的伤害会累计，挑战BOSS时血量不会恢复。

挖掘场深处

这是主线任务中第一次让玩家接触到深渊副本，难度随等级装备提高而增加，但新手玩家可以组队提高通关成功率。

特定副本

游戏中还有特定副本如斯巴达小妖精、暗黑神殿等，这些副本在手游中得到了保留和优化。

公会副本

公会机制完善，玩家可以参与捐赠、贡献兑换等活动，这些活动可能与特定副本相关联，提升公会成员的整体实力。

装备制作相关副本

如古代图书馆、古代武器库等，这些副本与装备制作相关，玩家可以获取制作装备所需的材料。

这些副本为玩家提供了丰富的游戏体验，包括挑战、探索、合作和装备获取。建议玩家根据自己的游戏进度和兴趣选择合适的副本进行挑战。